第二章 求宿霖府阻仇客 释忿仙山觅灵丹
出村后往东南行去，途中向一位女子问路，在她的引领下两人当晚在丹灵霖府借宿。在大厅见到忧容戚戚的主母金夫人，得知她丈夫与威虎山志空道长一同修行，志空为了一本《魔羽心法》而将金先生暗杀，儿子金犁也被志空所掳，日夜受地火焚身之苦。花木兰听了义愤填膺，自告奋勇前去威虎山找志空报仇。
此时府宅已被威虎山的人马包围，这里的战斗很简单，用芝华的弓箭远程引他们过来杀掉，打完院子里的银甲尊神，出门再打头目金甲尊神，没想到这家伙银样蜡枪头，几招过后便大声告饶，这时老气横秋的志空道长现身，趾高气扬地向金夫人索要某种重要的东西，花木兰看不过便要动手打起来，师父铁冠真人现身喝止，并斥责志空的蛮横行径，劝他释放金犁，志空仍然咄咄逼人地索要东西，铁冠便传授木兰“碧风回雪舞”，让她和芝华去对付志空老道。凭借新学的技能终于打败了志空，志空自知缘空道浅，当下万念俱灰打算随铁冠一起修行。铁冠和志空离开后，木兰受金夫人之托前往威虎山解救受困的金犁，在前往威虎山前建议先回花家村采买一些材料合成火药。
来到志空洞府外遇到要为主人复仇的金甲尊神，这里零散的喽罗可用芝华的“回首惊鸿”远程射杀，木兰四处拾取钱财和药物，敌人密集的地方跑过去扔两颗炸药轰杀。杀到洞府里面打败金甲尊神，这家伙终于服输，说金犁已中了蛮疆的七色莲之毒。上阶梯找到金犁后，两人接下来要想办法解除他身上的奇毒。
回到花家村找到那名江湖郎中，从他手里得到七色莲的解药(须完成药铲事件)，再回到志空洞府将解药给金犁服下，金犁终于慢慢地苏醒过来。金夫人赶来道谢，将一副翡翠手镯送给木兰。
[没有完成之前的药铲事件的话，两人对金犁的毒伤束手无策，最后金犁毒发身亡。金夫人见儿子惨死也悲恸万分，当下气绝身亡。两人将金氏母子安葬之后，看天色不早便继续上路投军。]
在志空洞府里找到两个宝箱，分别拿到地雷和10000钱。回到花家村外往南走往阴山军营，在吊桥前将军牌交给卫兵，稍后便往城里的元帅大帐报道。见到刘孙仪元帅道明父亲重病缠身的事情，将军得知木兰代父从军很是感动，安排她到将军府做伙头军。
第三章 阴山营众志御侮 黑水渡双女擒贼
两人在帐篷里安顿下来，木兰觉得管家马元奎有些诡异。离开帐篷到伙房报道，一名卫兵让朱芝华去后院搬柴禾，而花木兰则前往花园后的菜园摘菜。来到后花园的凉亭处遇到刘承仪的女儿刘芊芊，她将木兰当成柔然国派来的奸细，挥动皮鞭打了过来，木兰见她刁蛮任性便出手将她打倒在地，恰逢刘将军路过这里说明木兰的身份，让两人好生相处。
回到伙房看到刘芊芊被人捆住，解开她的束缚才知是马元奎干的，他是柔然国的奸细，已将北魏军的作战计划书送给柔然的权臣葛达勒塔。两人立即来到后花园的元帅书房，将马元奎通敌的事告知刘承仪，两人奉命前去黑水渡阻击马元奎。在离开军营前先找黄老板给芊芊买一身装备，并补充一下药剂和材料。
出城由西南赶往黑水渡，在山道上遇到落草为寇的焦文、焦武兄弟，木兰和芊芊见前后道路被堵，只好背水一战。将两兄弟打败后，白胡子老头焦周现身，他察觉木兰的招式有些眼熟，相问之下才知是铁冠的弟子，原来焦家是刘承仪的旧部，焦周也正是铁冠的同门师弟。焦周得知正是刘元帅招兵买马用人之际，便决定让焦氏兄弟从军捐躯。
两人继续前行杀掉一群强盗，来到修来茶社打听消息，得知茶社正是马元奎之母所开，如今马元奎已往山上采药去了。与马母攀谈之后，马母道出亡夫曾留下一本《紫书丹经》，吩咐交给叫木兰的有缘人。当她得知木兰正是丈夫要找的人，便将《紫书丹经》交给了她，书中写着“木兰西去东来”几个字，从书经学会招式“碧落疾风扫叶”。就在这时马元奎返回，两人见状奋身缉拿。来到屋外杀掉一群黑衣强盗，打败马元奎后刘芊芊将他的所做所为告知马母，马母得知儿子是叛国之贼，伤心中决定大义灭亲，将儿子交给两人带回军营发落。
元帅将战绩上报朝廷，皇上颁旨将木兰擢升为昭武将军，世袭爵位。木兰在帅帐见过刘元帅后，前往后花园见刘夫人，夫人打算将掌上明珠芊芊许配给木兰，木兰闻言面显难色，托辞离开。回到帅帐找元帅谈话，这时皇上驾到慰问三军将士，在帅帐中商量如何平定柔然之乱，花木兰献上三策：与北夷部落结为盟邦，互为唇齿；招贤纳士，招兵买马；安抚般悦、乌孙等部落，待机进攻柔然。皇上闻之大悦，命木兰和芝华前往般悦诸邦缔结盟约。
第四章 寻神医冷箭夺魄 解奇症般悦缔约
回到帐篷找芝华谈话，两人出城南行来到般悦国界，进入般悦城在街道上再次遇到马可波罗，得知他要寻找《印刷术》。来到王宫门前受到守卫的拦阻，这时有两种选择。
选择1：“不管了，杀进去。”消灭门口的卫兵后见到般悦可汗，花木兰将要结盟的来意禀告，可汗三思后仍不肯结盟，北魏与般悦两国的关系破裂，两人只好往其它部落继续游说。
选择二：“再想想别的办法。”劝降结盟不好用武力冲突，两人只好另寻它法。在城里分别找老翁和小孩谈话，得知公主得了一种失心疯的怪病，群医束手无策，令大汗心情不畅，看来这是接近大汗的一个契机，两人于是在城中寻访神医。来到酒楼听食客说城里的神医是一位小姑娘，日前已往城外采药去了。来到城外看到两名身着北魏军服的官兵正要捉拿神医，两人上前将官兵打败查问情由，谁知官兵守口如瓶，两人看其情状可怜放其逃生。上前与女神医谈话，神医说明治疗失心疯的秘方药剂存放在家中，这时一名神秘军人在树丛中放冷箭将神医射杀。回到城外找商贩谈话，这时茶楼的门可进去了，在里面找到一名逃难的落魄书生，从他手上拿到一本《印刷术》，回到城中将它交给马可波罗，可选择奖品：10000钱或高级炸药合成秘方。
在城西南找到神医的家，从宝箱里拿到一颗清心丹，回到王宫前找守卫通报。进入王宫大厅见到可汗，花木兰一番滔滔雄辩使可汗回心转意顺降北魏，花木兰再将药奉上将公主的病情控制好转，可汗更是大悦，发誓终生臣服北魏。在离开前到装备店买一套新防具，然后到道具店采买材料合成炸药，由北方城门出去前往兰密格儿沙漠。
